业务概要
货代与运输企业的资金链条很长，因此首先要确定自己的销售额到哪里为止。是将向货主收取的运费全额视为销售额，还是仅取扣除支付给承运人运费后的差额，收入金额会相差数倍。加之国际区段适用零税率、国内区段应税，垫付的仓储费与通关手续费的税务发票以谁的名义开具与接收，也是每每出现的问题。
VALUE税务会计先看合同的实质。依据是以自己的责任与计算约定承运，还是仅从事居间安排，来划分总额与净额，并一以贯之地适用该标准。将国际复合运输与国内运输区段分开，备齐零税率凭证，理顺垫付款与操作手续费的税务发票流向。物流产业属于中小企业税额减免的适用行业，故一并核查减免要件。
运输物流业主要税务问题
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01
先要定总额还是净额
所得税执行标准规定：向货主收取的金额中，仅居间报酬即手续费计入收入总额；但若约定以自己的责任承运他人货物、实质上经营运输业，则向货主收取的金额全额计入收入总额。合同、提单与责任承担结构是该判断的依据，因此须先使文件保持一致。
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02
国际区段适用零税率，国内区段不适用
依国际复合运输合同接收货主货物并以自己的责任与计算承运的，属于外国航行服务，适用零税率。而仅在境内从一地运至另一地的区段则不适用零税率。若将运输必然附随的包装等一并提供，可随同适用零税率；若属独立服务，则另行课税。
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03
垫付款与手续费性质不同
海运运费与附加费、保税运输费、仓储保管费、内陆运输费等先行代付的款项，与操作手续费性质不同。外国运输企业提供的运费免予开具税务发票，但国内区段的应税服务必须向实际接受服务的一方开具税务发票。关税师的通关手续费同样以谁是接受服务方来判断。
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04
纯居间安排时开票方式不同
仅从事运输居间安排的，只就居间报酬即手续费开具税务发票；货物运输本身则以承运人名义向货主开具税务发票，并在备注栏填写居间业者的登记号码。若不了解这一结构而全部以自己的名义开票，可能演变为虚开税务发票问题。
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05
物流产业属于减免适用行业
包括国际物流周转业在内的物流产业，依《租税特例限制法》属于中小企业特别税额减免的适用行业，同时也属于创业中小企业税额减免的适用行业。符合要件即可直接减少税额，因此宜先确认行业代码与中小企业要件。
VALUE税务会计的应对
确定收入确认标准
依据合同实质确定总额或净额后，对所有交易适用同一标准。
按区段梳理零税率
区分国际运输与国内运输，按区段对应零税率发票与凭证。
垫付款与减免核查
理顺垫付款与手续费的税务发票流向，并确认物流产业税额减免要件。
运输物流业税务常见问题
Q 货代收款是否全部计入销售额？ expand_more
视合同实质而定。若约定以自己的责任与计算承担起运地至目的地的全程运输，则向货主收取的金额全额为收入总额，支付给承运人的运费计为销售成本。反之，若仅从事居间安排，则只有手续费属收入总额。合同与提单是该判断的依据，故应先整理文件。
Q 国内区段运输也适用零税率吗？ expand_more
不适用。在境内从一地运至另一地并收取对价的服务不适用零税率。不过也有符合要件即可适用的情形，例如国内货代就进口货物自到达港运至货主仓库，并通过外汇银行自外国货代收取对价。从谁处、以何种方式收取款项，正是分水岭。
Q 海外代购配送代办也能适用零税率吗？ expand_more
依《物流政策基本法》登记国际物流周转业的经营者，受国内消费者委托在海外仓库接收物品，并以自己的责任与计算运至国内的，可以适用零税率。是否登记与责任结构是要件，因此宜先检视业务结构。
Q 外国船公司的运费也需要取得税务发票吗？ expand_more
外国运输企业提供的运费免予开具税务发票。但与国际复合运输相分离、发生于境内的应税服务，例如保税仓储费或国内内陆运输费，必须向实际接受该服务的一方开具税务发票，因此需将交易结构拆分审视。
Q 运输物流业也能享受税额减免吗？ expand_more
包括国际物流周转业在内的物流产业，既属中小企业特别税额减免的适用行业，也属创业中小企业税额减免的适用行业。但适用与否及减免比例因行业代码、中小企业要件、创业地区与时点而异，故在决算前先行确认更为稳妥。